Facturation électronique 2026-2027 : ce qui change pour votre boutique en ligne

Depuis le 1er septembre 2026, toute entreprise française assujettie à la TVA doit pouvoir recevoir des factures électroniques. Le 1er septembre 2027, votre boutique devra aussi en émettre et déclarer ses ventes aux particuliers.
Beaucoup de nos clients e-commerçants pensent que Wix ou Shopify vont régler ça tout seuls. Ce n'est pas le cas. Voici ce qui change vraiment, ce que ça coûte et par quoi commencer.
Les deux dates à retenir, et ce qu'elles veulent dire pour vous
La réforme avance en deux temps. Le calendrier a déjà glissé deux fois, mais cette fois les dates sont inscrites dans la loi de finances 2026 et la première est déjà passée.
1er septembre 2026 : toutes les entreprises, y compris les micro-entreprises en franchise de TVA, doivent pouvoir recevoir des factures électroniques via une plateforme agréée. Les grandes entreprises et les ETI doivent déjà en émettre.
1er septembre 2027 : les PME, TPE et micro-entreprises doivent à leur tour émettre leurs factures entre professionnels au format électronique et transmettre leurs données de ventes, ce qu'on appelle le e-reporting.
Concrètement, si vous vendez en ligne depuis une boutique Wix ou Shopify, vous êtes concerné dès aujourd'hui pour la réception. Vos fournisseurs (hébergeur, transporteur, grossiste) vont, tôt ou tard, vous envoyer leurs factures par ce canal.
Un PDF envoyé par email n'est plus une facture électronique au sens de la réforme. Le format attendu est structuré : Factur-X (un PDF lisible avec des données intégrées), UBL ou CII. Votre outil s'en occupe, mais il faut un outil.
Une plateforme agréée, pas un portail public gratuit
Le portail public de facturation ne permet ni d'émettre ni de recevoir des factures. Il sert d'annuaire : il indique, pour chaque SIREN, par quelle plateforme passer. Il n'existe donc pas d'outil gratuit de l'État pour facturer.
Vous devez choisir une plateforme agréée (on disait PDP jusqu'en 2025). La DGFiP en listait 149 au 1er septembre 2026, d'après le décompte de Presse-citron. Votre expert-comptable en a presque toujours une à vous proposer, souvent incluse dans son abonnement.
Comptez entre zéro euro, quand elle est incluse par le cabinet comptable, et quelques dizaines d'euros par mois pour une TPE. Les logiciels de facturation et de compta courants comme Pennylane, Sage ou Sellsy ont déjà leur connexion.
Une boutique de décoration que nous suivons a réglé la question en vingt minutes : son cabinet l'a inscrite sur sa plateforme et dans l'annuaire. Elle n'a rien changé à son site Wix.
Wix et Shopify ne sont pas des plateformes agréées, et c'est normal
Ni Wix ni Shopify ne figurent dans la liste des plateformes agréées, et ils n'ont pas vocation à y être. Ce sont des couches commerce : ils encaissent, gèrent les commandes et envoient la confirmation au client.
La facture au sens fiscal, elle, doit sortir d'un outil de facturation compatible, relié à votre plateforme agréée. Le fil de la communauté Shopify francophone le résume sans détour : Shopify n'est pas, et ne sera pas, une plateforme agréée. Même logique côté Wix.
Deux pièges que nous voyons souvent chez les boutiques que nous suivons :
Le numéro de commande ne peut pas servir de numéro de facture. La numérotation doit être chronologique et continue, ce qu'un numéro de commande ne garantit pas.
La facture maison en PDF générée par une app de la boutique ne vaut pas facture électronique si elle n'est pas transmise par une plateforme agréée au format structuré.
Le client professionnel qui commande comme un particulier : sans SIREN collecté à la commande, impossible d'émettre une facture conforme ensuite.
Bonne nouvelle : la connexion commande vers facture existe déjà entre Wix Stores ou Shopify et les grands logiciels de compta. Le vrai travail, c'est de vérifier qu'elle est en place et qu'elle génère les bonnes mentions.
Vos ventes aux particuliers : pas de facture, mais un e-reporting
Si vous vendez surtout à des particuliers, pas de panique : vous ne leur enverrez aucune facture électronique. Le client reçoit son ticket ou sa facture comme aujourd'hui.
En revanche, à partir de septembre 2027, vous devrez transmettre à l'administration le total de vos ventes aux particuliers, par jour, via votre plateforme agréée. La fréquence dépend de votre régime de TVA : tous les deux mois en franchise en base, jusqu'à trois fois par mois au réel normal mensuel.
Le point clé, c'est la fiabilité de la source. Vos chiffres déclarés doivent coller à vos encaissements et à vos remboursements. Une boutique qui vend sur Wix, sur Instagram et en magasin doit consolider ses canaux dans un seul outil.
Pour les ventes à des professionnels, quatre mentions deviennent obligatoires sur la facture, dont le SIREN du client. Votre boutique doit donc distinguer un acheteur pro d'un particulier et collecter ce SIREN au moment de la commande.
Ce que ça coûte si vous ne faites rien
Les sanctions sont fixées par la loi de finances 2026, et le Journal du Net les détaille. Elles sont modérées, mais elles s'additionnent vite pour une boutique qui facture beaucoup de professionnels.
Facture non émise au format électronique : 50 euros par facture, plafonnés à 15 000 euros par année civile.
Aucune plateforme désignée : 500 euros après une mise en demeure restée trois mois sans effet, puis 1 000 euros par trimestre supplémentaire.
E-reporting non transmis : 500 euros par transmission manquante, plafonnés à 15 000 euros par année civile.
Une première infraction n'est pas sanctionnée si vous régularisez spontanément ou dans les 30 jours après une demande de l'administration. Le risque immédiat est donc limité.
Le vrai coût, c'est ailleurs : le fournisseur dont vous ne voyez plus les factures parce que vous n'êtes pas dans l'annuaire, et la clôture comptable qui déraille faute de données propres.
Par où commencer
Cette semaine : demandez à votre expert-comptable sur quelle plateforme agréée vous êtes inscrit et vérifiez votre présence dans l'annuaire. Si la réponse est floue, c'est le premier chantier.
D'ici fin novembre : listez vos ventes par type (particuliers, professionnels, étranger) et vos outils actuels : boutique, caisse, logiciel de facturation, banque.
D'ici début 2027 : choisissez votre logiciel d'émission avec votre comptable. Vérifiez qu'il gère le e-reporting des ventes aux particuliers et qu'il se connecte à votre boutique Wix ou Shopify.
Premier semestre 2027 : adaptez la boutique. Case « je suis un professionnel » et champ SIREN au paiement, mentions légales à jour sur vos modèles de facture.
Avant l'été 2027 : testez sur de vraies commandes, une à un particulier et une à un professionnel, et faites valider le résultat par votre comptable.
Ce qu'on en retient
La réforme ne se joue pas dans votre boutique Wix ou Shopify, mais autour d'elle : une plateforme agréée, un logiciel de facturation relié, et des données de vente propres.
La réception est obligatoire depuis septembre 2026, l'émission et le e-reporting arrivent en septembre 2027. Dix mois, c'est confortable si vous commencez maintenant, intenable si vous attendez juin.
Défricher ce terrain une bonne fois vous évitera des pénalités, et surtout des heures de ressaisie à chaque clôture.
Vous avez une boutique Wix Stores ou Shopify et vous ne savez pas où en est votre circuit de facturation ? Chez les défricheurs agency, on vous l'installe : audit de vos flux de vente, branchement de votre logiciel de facturation à la boutique, champ SIREN et case professionnel au paiement.
On termine par un test grandeur nature avec votre comptable. Réservez un créneau ou découvrez nos services Wix.




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